JUTRA merupakan salah satu bahagian di bawah Sektor Logistik. Fungsi utama bahagian ini adalah untuk menyedia dan mengurus perkhidmatan pembaikan serta senggaraan aset marin dan pesawat udara APMM bagi membolehkan ia beroperasi sepenuhnya agar APMM berupaya melaksanakan tugas terasnya dengan lancar serta berkesan di Zon Maritim (ZM) Negara. JUTRA dibahagikan kepada 3 cawangan seperti berikut:
a.Cawangan Kejuruteraan Marin;
b.Cawangan Pengurusan dan Kontrak; dan
c.Cawangan Kejuruteraan Udara.